發(fā)布日期：2017-09-01

中國科學技術(shù)大學副教授阮科課題組在核磁共振研究中等親和力的化學工具分子和靶點蛋白作用模式方面取得重要進展。相關(guān)研究成果于8月29日在線發(fā)表在《德國應(yīng)用化學》上，論文的共同第一作者是中國科大博士生高佳和清華大學博士生梁鄂。

蛋白-配基的相互作用模式是理性藥物發(fā)現(xiàn)的核心。復合物晶體結(jié)構(gòu)研究受限于小分子的水溶性，而中等親和力的先導化合物通常處于核磁中等交換尺度，導致結(jié)合界面的核磁共振信號譜線嚴重增寬甚至無法檢測，這對核磁共振研究先導化合物和靶點蛋白作用模式提出了嚴峻挑戰(zhàn)。研究人員通過極低的蛋白-配基摩爾比緩解了化學交換導致的譜線增寬效應(yīng)，運用19F的化學交換飽和傳遞（CEST），測定了低豐度結(jié)合態(tài)的鑭系金屬標記的BRM bromo結(jié)構(gòu)域的單F及雙F小分子抑制劑的19F贗接觸位移（PCS）。研究人員命名這一新方法為19F PCS-CEST，它提供了蛋白-配基件的重要結(jié)構(gòu)約束，從而挑選出分子對接的最佳結(jié)合模式，并與另一個高水溶性類似物的復合物晶體結(jié)構(gòu)相一致。

這一方法解決了核磁共振表征中等親和力范疇的先導化合物與靶標的結(jié)合模式的難題，拓展了核磁共振在結(jié)構(gòu)指導的苗頭化合物到先導化合物演化中的應(yīng)用。

該工作得到了中科院戰(zhàn)略性先導科技專項、國家重點研發(fā)項目、973和國家自然科學基金委的資助。

來源：中國科學技術(shù)大學